1.安全性
PHP开发的网站一般安全性不是太高，由所以开源的代码；ASP/.NET开发的网站安全性会高点，是闭源的。小程序因为代码都上传到了微信服务器上，所以安全性是比较高的，并且域名都是HTTPS认证的。
2.打开方式
网站一般通过浏览器或搜索引擎才能打开。而小程序就简单多了，只要扫一扫或直接从小程序的入口才能进。从应用范围来看，网站的受众。
3.加载速度
小程序要比网站加载速度快，在同样的条件下，网站需要加载代码，特别是有些网站js效果写的比较多，加载速度会更慢点。而小程序的基本元素是不需要加载的。
4.限制性
网站只需有域名，空间和代码就能做好，不过国内的空间需要做存案，要放正规合法的内容；当然也有许多网站用的国外和香港的空间，基本上没有什么限制性，比较方便快捷，缺陷是易进犯，不稳定。而小程序是必须通过微信审核通过后才干发布上线，有些功用也会受微信的限制。